这一次的成败关系极为重大，直接影响之后的一系列战役。郑成功身先士卒，部将们也以一当十，使瓜州一役大获全胜。
胜利之后，郑成功严令部下，不得惊扰当地百姓，要百姓们照常生活。
瓜州之役，旗开得胜，使郑家军军心大振，斗志高昂。郑成功在欣喜之余，提笔赋诗道：
京口瓜州指顾问，
春风几度到钟山。
迷离绿遍江南地，
千里怀人去不还。
瓜州之役，清军猛烈的炮火，足以使郑家军粉身碎骨。但是忠勇的战士不惧艰险，摧毁了“滚江龙”以及坚固的木城，终于获得胜利。
镇江在长江下游的南岸，是一个非常重要的军事据点，战略地位比瓜州更加重要。郑家军攻下瓜州后，郑成功想以胜利的高昂士气直取镇江。他认为因为用兵最重要的就是速战速决，必须挟胜利之余威，趁敌人来不及防备之时进攻镇江，一鼓作气把镇江城拿下来。于是就向张煌言询问他对这个决定有何看法。
张煌言的看法是，清军虽然在瓜州战败，但是并没有伤到清军力量的根本，他们只是暂退到芜湖。清军极可能会趁郑家军不备，从半路突击出来。最好的办法是，把军队分成两路。先派海军去消灭清政府在芜湖的海军力量。另派一支军队进攻镇江，这样就不会在中途遭受突击，免去后顾之忧。