（三）兴办慈善事业
教会也在中国创办慈善机构，开展医疗、慈幼及救济等事业，以此作为传教的手段及向中国社会渗透的途径。美国基督教差会负责人司弼尔曾明确宣称：“我们的慈善事业，应该以直接达到传播基督教福音和开设教堂为目的。”
1834年美国派遣的第一个传教医生伯驾来到广州，次年在十三行内的新豆栏街开设眼科医局。到1900以前，全国各地陆续出现了一批教会医院或诊所。法国天主教最早设立的医院是1845年创立于天津的法国医院，此后有名的还有开设于九江（1882年）、南昌（1890年）的法国医院以及1894年开设于青岛的天主堂养病院；另外还有数十处小型诊所。基督教教会开办的医院中最有名的是1859年创办的广州博济医院。此外，属于英国教会系统的有上海的仁济医院（1844年）、汉口的仁济医院（1866年）、汕头的福音医院（1867年）、杭州的广济医院（1880年）、天津的马大夫医院（1881年）、武昌的仁济医院（1885年）、福州的柴井医院（1887年）、北海的北海医院（1890年）、宜昌的普济医院（1879年）等20多所。属于美国教会系统的除广州博济医院外，还有上海的同仁医院（1867年）、苏州的博习医院（1883年）、通州的通州医院（1886年）、南京的鼓楼医院（1892年）、重庆的宽仁男医院（1892年）等30余所。这些医疗机构在“传播基督教福音”的同时，也将西医、西药以及近代医院制度、医学教育传入了中国。