治水的过程同样伴随着相关法律法规的不断出台和完善。针对一些对法律法规熟视无睹的行为，国家加大了执行和惩罚力度，使得治水这场攻坚战具有了更强的法律保护力。如针对日益严重的水污染问题，国务委员、国务院环卫会主任宋健曾经指出：“我们的法律最初太软，弹性太大、像社论。”之后，他积极促成了《水污染防治法》的全面修改，增强了其可操作性。
同时，在工程建设方面，部分条件成熟的地区，在治水过程中结合本地区的实际，探索出了项目法人责任制与行政首长负责制相结合的监管体制，这一方面有利于发挥行政的督导作用，同时亦是对提高治水效率的有益尝试。在有的地方，更是走出了公益水利工程建设管理体制创新的路子。这些治水相关制度的不断完善，无疑要在中国治水史上留下重重的一笔，它标志着中国治水史已然迈入一个全新的阶段，一个可以被称为系统化、制度化的治水新时代。从一部厚重的《中国治水史诗》中，我们能够看到治水制度化不断完善的历史演进进程，同时，治水理念也发生着深刻的变化，逐渐朝着生态化、自然化和人性化的方向发展，并进而带出一个城市建设的新范式。这可以看成是不断融入创新思维的治水史带给社会城市建设的新启示。
