万历十九年（1591年），不知因为何事，宣化镇附近有两名部落首领背叛盟约，率兵进入边境引起骚乱。三娘子闻讯后，立即派兵前去征讨，最终擒获叛乱的两名部落首领，使得边塞又恢复了平静。同年秋季，位于塞外草原西侧的火落赤部落挑起事端，顺义王扯力克居然背着三娘子，私自出兵帮助火落赤部落扰乱明朝所属的洮河等地。明朝边关将领立即派遣使者将军情告知三娘子。三娘子得知这一消息后，迅速派出使者前往火落赤部落，要求扯力克立即率兵东归。扯力克迫于三娘子的压制，非常不情愿地率兵而归，洮河之乱也就此平息。因为此事，明朝政府下令停止通贡互市两年，三娘于对此深表歉意，又将挑起事端者缉拿后送交明朝边关将领。于是，明朝政府又下令恢复中断的通贡互市。
万历二十二年（1594年），扯力克去世，围绕着王位的继承问题，扯力克的孙子卜石兔台吉和三娘子的孙子素襄台吉之间发生了一场夺嫡之争。后来，三娘子不徇私情，遵循俺答汗生前与明朝政府达成的“世代相传为王，以长部落归心”的约定，毅然将顺义王印移交给了卜石兔台吉。为此，素襄台吉多次咒骂其奶奶三娘子，憎恨其不将王印相授。